我國幅員遼闊，保健食品原料來源豐富，包含中藥材原料、普通食品、菌藻類、海洋食品、營養素、新資源等。《關于進一步規范保健食品原料管理的通知》，遴選出“既是食品又是藥品的品種”和“可用于保健食品的物品”，共計有204種。其中，山藥、茯苓、枸杞、百合、菊花、人參、鹿茸、黃芪、當歸、紅景天、刺五加等，均為我國特有的道地藥材。此外，可用于具有中醫特色的保健食品的原料還有營養豐富、味道鮮美的食用真菌類，如蘑菇、香菇、金針菇、木耳、毛木耳、銀耳和滑菇等，均可增強機體的免疫功能；昆蟲類，如螞蟻（擬黑多刺蟻）、蝎子、蜂膠、蜂王漿等，蛋白質含量高、氨基酸種類齊全、微量元素豐富；海產品類，如海藻、海膽、海蜇等，可發揮輔助降血脂、抗氧化的保健功能。同時，目前臨床使用的中藥材數量達12807種，為保健食品原料的開發提供了廣闊的空間。

        我國自然條件復雜，地形、土壤、氣候多樣，植物資源十分豐富。據統計，僅高等植物就有三萬多種，在這些豐富的植物中，許多種類具有重要的經濟用途，同時它們的作用正隨著生產的發展和科學研究的深入而不斷被人們所發現。世界衛生組織正式確定的藥用植物有2萬種，但只有二百多種作過較詳盡的研究，我國中草藥種類在6000種以上、香料植物約350種、油脂植物有800種、釀酒和食用植物約300種。衛生部先后3次共批準了87種藥食兩用的中藥材名單，它們是生產中藥類保健食品的重要原料。其中，常用中藥保健食品原料及功效成分包括：

        1.多糖類

        多糖不僅是一類非特異性免疫增強劑而且有降血糖、降血脂、降血清過氧化脂質和膽固醇濃度、抗血凝、抗癌等多種作用。主要存在于香菇、靈芝、蟲草、枸杞、當歸、黃芪、藻類、銀耳、紅花、龜、鱉等物品中，以此類原料為主的中藥保健食品申報的保健功能主要有增強免疫力功能、輔助降血脂功能。

        2.皂苷

        皂苷廣泛存在于植物界，是不少中草藥的主要功效成分，具有抗衰老、抗疲勞、促進學習記憶、保護心血管系統作用。存在于人參、西洋參、絞股藍、紅景天、黃芪、黃精、刺五加、金盞花中，以此原料為主的產品申報的保健功能主要有緩解體力疲勞、改善生長發育、抗氧化等功能。

        3.黃酮類

        黃酮類是數目眾多的一類化合物，廣泛存在于植物中，在中草藥中也是一類重要的流行性成分。具有降血清膽固醇、抗缺氧、降血壓、降血脂、抑制脂質過氧化、改善循環等作用。存在于銀杏葉、花粉、果仁及姜科等植物中，以此原料為主的產品申報的保健功能主要有輔助降血脂、增強免疫力、輔助降血壓等功能。

        4.低聚糖魔芋

        具有促進腸胃功能,防治便秘,提高人體免疫功能的作用。以此原料為主的產品申報的保健功能主要有減肥、改善胃腸功能、增強免疫力。

        5.脂肪酸

        植物油(單不飽和脂肪酸和多不飽和脂肪酸)、鯊魚油(DHA，EPA)。具有降低血脂、抑制血栓形成和抗脂質過氧化等作用。以此原料為主的產品申報的保健功能主要有輔助降血脂功能。

        6.其它

        廣泛用于保健食品開發的中藥材包括刺梨、苦丁茶、天麻、花粉、蜂王漿、南瓜、甘草、山藥等等。以此原料為主的產品申報的保健功能主要有增強免疫力、減肥、保護肝臟。